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Analisi microbiologiche e molecolari

M3R svolge analisi microbiologiche-molecolari per la caratterizzazione delle comunità microbiche nelle diverse matrici ambientali (suolo, acque sotterranee ed aria) e per il monitoraggio dei processi di degradazione biologica. Tali analisi vengono eseguite attraverso innovative tecniche di biologia molecolare per valutare la presenza di microrganismi (batteri, funghi ed archaea) metabolicamente interessanti per applicazioni ambientali, ovvero per:

 

  • la determinazione delle potenzialità biodegradative di un sito contaminato;

  • il monitoraggio del processo di biodegradazione dei contaminanti

 

I nostri laboratori si trovano presso il Dipartimento di Scienze dell'Ambiente e della Terra dell’Università di Milano-Bicocca e sono attrezzati con strumentazione d’avanguardia per l’esecuzione delle analisi microbiologiche-molecolari.

I nostri servizi includono le seguenti analisi:

  • Arricchimento e caratterizzazione di ceppi microbici con capacità degradative;

  • Estrazione DNA genomico ed RNA da campioni ambientali o ceppi microbici;

  • Sequenziamento NGS gene per SSU o ITS (min 20000 reads paired end 250x2);

  • Analisi bioinformatica ed elaborazione dati sequenziamento NGS gene per SSU o ITS;

  • Quantificazione numero copie gene mediante PCR quantitativa  (qPCR)